Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Apache Tomcat supporta almeno 2 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Apache Tomcat sono .DO. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Apache Tomcat. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Apache Tomcat.
Apache Tomcat può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Apache Tomcat e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Apache Tomcat.