Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Apple DVD Studio Pro supporta almeno 2 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Apple DVD Studio Pro sono .BUP. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Apple DVD Studio Pro. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Apple DVD Studio Pro.
Apple DVD Studio Pro può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Apple DVD Studio Pro e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Apple DVD Studio Pro.