Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Apple Qmaster supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Apple Qmaster sono .COMMANDERDOC. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Apple Qmaster. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Apple Qmaster.
Apple Qmaster può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Apple Qmaster e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Apple Qmaster.