Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Bamboo Paper for Desktop supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Bamboo Paper for Desktop sono .BAMBOOPAPER. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Bamboo Paper for Desktop. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Bamboo Paper for Desktop.
Bamboo Paper for Desktop può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Bamboo Paper for Desktop e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Bamboo Paper for Desktop.