Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. BSA Commander supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da BSA Commander sono .BSA. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in BSA Commander. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da BSA Commander.
BSA Commander può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite BSA Commander e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da BSA Commander.