Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. CA Desktop DNA Migrator supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da CA Desktop DNA Migrator sono .DNA. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in CA Desktop DNA Migrator. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da CA Desktop DNA Migrator.
CA Desktop DNA Migrator può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite CA Desktop DNA Migrator e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da CA Desktop DNA Migrator.