Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Duke Nukem Forever supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Duke Nukem Forever sono .DNF. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Duke Nukem Forever. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Duke Nukem Forever.
Duke Nukem Forever può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Duke Nukem Forever e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Duke Nukem Forever.