Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Eclipse Memory Analyzer supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Eclipse Memory Analyzer sono .HPROF. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Eclipse Memory Analyzer. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Eclipse Memory Analyzer.
Eclipse Memory Analyzer può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Eclipse Memory Analyzer e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Eclipse Memory Analyzer.