Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. GNU project C supporta almeno 5 diverse estensioni di file. I file di base supportati da GNU project C sono .LUA. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in GNU project C. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da GNU project C.
GNU project C può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite GNU project C e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da GNU project C.