Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. GPS Pathfinder Office supporta almeno 5 diverse estensioni di file. I file di base supportati da GPS Pathfinder Office sono .SSF. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in GPS Pathfinder Office. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da GPS Pathfinder Office.
GPS Pathfinder Office può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite GPS Pathfinder Office e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da GPS Pathfinder Office.