Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. InterCrypto Advanced Encryption Package supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da InterCrypto Advanced Encryption Package sono .AEPKEY. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in InterCrypto Advanced Encryption Package. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da InterCrypto Advanced Encryption Package.
InterCrypto Advanced Encryption Package può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite InterCrypto Advanced Encryption Package e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da InterCrypto Advanced Encryption Package.