Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Kindle Collection Manager supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Kindle Collection Manager sono .AZW2. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Kindle Collection Manager. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Kindle Collection Manager.
Kindle Collection Manager può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Kindle Collection Manager e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Kindle Collection Manager.