Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Massively Parallel Quantum Chemistry Program supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Massively Parallel Quantum Chemistry Program sono .QCI. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Massively Parallel Quantum Chemistry Program. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Massively Parallel Quantum Chemistry Program.
Massively Parallel Quantum Chemistry Program può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Massively Parallel Quantum Chemistry Program e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Massively Parallel Quantum Chemistry Program.