Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. MRF Mapping Tool Kit supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da MRF Mapping Tool Kit sono .ULF. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in MRF Mapping Tool Kit. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da MRF Mapping Tool Kit.
MRF Mapping Tool Kit può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite MRF Mapping Tool Kit e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da MRF Mapping Tool Kit.