Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Myst 10th Anniversary Collection supporta almeno 2 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Myst 10th Anniversary Collection sono .M3S. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Myst 10th Anniversary Collection. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Myst 10th Anniversary Collection.
Myst 10th Anniversary Collection può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Myst 10th Anniversary Collection e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Myst 10th Anniversary Collection.