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Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Navicat Premium (Linux) supporta almeno 33 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Navicat Premium (Linux) sono .SQL. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Navicat Premium (Linux). Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Navicat Premium (Linux).
Navicat Premium (Linux) può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Navicat Premium (Linux) e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Navicat Premium (Linux).