Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. NDS tools supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da NDS tools sono .SWAV. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in NDS tools. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da NDS tools.
NDS tools può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite NDS tools e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da NDS tools.