Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. NetBeans supporta almeno 6 diverse estensioni di file. I file di base supportati da NetBeans sono .GROOVY. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in NetBeans. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da NetBeans.
NetBeans può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite NetBeans e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da NetBeans.