Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Perl Code Editor supporta almeno 4 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Perl Code Editor sono .PL. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Perl Code Editor. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Perl Code Editor.
Perl Code Editor può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Perl Code Editor e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Perl Code Editor.