Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. PIPE-FLO Professional supporta almeno 3 diverse estensioni di file. I file di base supportati da PIPE-FLO Professional sono .PIPE. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in PIPE-FLO Professional. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da PIPE-FLO Professional.
PIPE-FLO Professional può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite PIPE-FLO Professional e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da PIPE-FLO Professional.