Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Plex Media Center for OS X supporta almeno 3 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Plex Media Center for OS X sono .MKV. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Plex Media Center for OS X. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Plex Media Center for OS X.
Plex Media Center for OS X può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Plex Media Center for OS X e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Plex Media Center for OS X.