Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. SC4Tool supporta almeno 3 diverse estensioni di file. I file di base supportati da SC4Tool sono .SC4LOT. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in SC4Tool. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da SC4Tool.
SC4Tool può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite SC4Tool e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da SC4Tool.