Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. SEwin supporta almeno 2 diverse estensioni di file. I file di base supportati da SEwin sono .SRL. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in SEwin. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da SEwin.
SEwin può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite SEwin e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da SEwin.