Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Star Wars Jedi Knight: Dark Forces II supporta almeno 3 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Star Wars Jedi Knight: Dark Forces II sono .JKS. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Star Wars Jedi Knight: Dark Forces II. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Star Wars Jedi Knight: Dark Forces II.
Star Wars Jedi Knight: Dark Forces II può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Star Wars Jedi Knight: Dark Forces II e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Star Wars Jedi Knight: Dark Forces II.