Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Swish-E supporta almeno 4 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Swish-E sono .CONFIG. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Swish-E. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Swish-E.
Swish-E può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Swish-E e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Swish-E.