Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. The Games Factory supporta almeno 2 diverse estensioni di file. I file di base supportati da The Games Factory sono .MFX. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in The Games Factory. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da The Games Factory.
The Games Factory può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite The Games Factory e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da The Games Factory.