Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Virtual CD supporta almeno 14 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Virtual CD sono .MDF. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Virtual CD. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Virtual CD.
Virtual CD può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Virtual CD e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Virtual CD.