Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Vocal Synthesizer Tool UTAU supporta almeno 2 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Vocal Synthesizer Tool UTAU sono .VSQ. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Vocal Synthesizer Tool UTAU. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Vocal Synthesizer Tool UTAU.
Vocal Synthesizer Tool UTAU può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Vocal Synthesizer Tool UTAU e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Vocal Synthesizer Tool UTAU.