Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Wiimms WDF Tool supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Wiimms WDF Tool sono .WIA. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Wiimms WDF Tool. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Wiimms WDF Tool.
Wiimms WDF Tool può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Wiimms WDF Tool e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Wiimms WDF Tool.