Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. Palm OS Emulator supporta almeno 1 diverse estensioni di file. I file di base supportati da Palm OS Emulator sono .SIS. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in Palm OS Emulator. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da Palm OS Emulator.
Palm OS Emulator può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite Palm OS Emulator e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da Palm OS Emulator.