Per impostazione predefinita, tutto il software supporta più estensioni di file. iTunes supporta almeno 64 diverse estensioni di file. I file di base supportati da iTunes sono .MP4. Tuttavia, non tutte le estensioni elencate nell'elenco vengono sempre utilizzate per salvare gli effetti del lavoro in iTunes. Molto spesso, i file con tali estensioni vengono utilizzati come file di dati di origine utilizzati da iTunes.
iTunes può essere utilizzato per convertire i formati di file tra le estensioni di file elencate di seguito. È possibile aprire un file con una delle estensioni di file di seguito tramite iTunes e provare a salvarlo in un altro formato di file, supportato anche da iTunes.